La SEP tiene la facultad de dictar acuerdos y promover convenios que dentro de su ámbito de competencia le sean de interés y necesarios como apoyo en el cumplimiento de sus funciones. Destaca, entre ellos, el Acuerdo Nacional para la Modernización de la Educación Básica.  Promulgado en el Diario Oficial el 19 de mayo de 1992. El decreto para la celebración de convenios en el marco del mismo fue publicado en la misma fecha, y a la letra dice:  "El Ejecutivo Federal, por conducto de la Secretaría de Educación Pública y con la participación que corresponda a otras dependencias y entidades de la Administración Pública Federal, propondrá a los gobiernos de las entidades federativas, en el marco del Acuerdo Nacional para la Modernización de la Educación Básica, la celebración de los convenios que sean necesarios para el oportuno y cabal cumplimiento del mencionado Acuerdo."

Otros acuerdos pueden ser consultados en la página web de la SEP, en este vínculo.